Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms