Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF275Q9NSD4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF275Q9NSD4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF275Q9NSD4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF275Q9NSD4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF275Q9NSD4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF275Q9NSD4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF275Q9NSD4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF275Q9NSD4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF275Q9NSD4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF275Q9NSD4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF275Q9NSD4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF275Q9NSD4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF275Q9NSD4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF275Q9NSD4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF275Q9NSD4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF275Q9NSD4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF275Q9NSD4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF275Q9NSD4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF275Q9NSD4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF275Q9NSD4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF275Q9NSD4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF275Q9NSD4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF275Q9NSD4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms