Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms