Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms