Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

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Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.2■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
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