Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms