Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC31BQ9NQW1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC31BQ9NQW1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC31BQ9NQW1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC31BQ9NQW1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC31BQ9NQW1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC31BQ9NQW1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC31BQ9NQW1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC31BQ9NQW1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC31BQ9NQW1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC31BQ9NQW1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC31BQ9NQW1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC31BQ9NQW1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC31BQ9NQW1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC31BQ9NQW1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SEC31BQ9NQW1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SEC31BQ9NQW1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms