Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRHQ9HD43 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms