Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms