Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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