Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms