Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms