Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PACSIN1Q9BY11 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms