Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms