Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH6

RPAP1, RNA polymerase II-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP1Q9BWH6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP1Q9BWH6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPAP1Q9BWH6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPAP1Q9BWH6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPAP1Q9BWH6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPAP1Q9BWH6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPAP1Q9BWH6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
RPAP1Q9BWH6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPAP1Q9BWH6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPAP1Q9BWH6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RPAP1Q9BWH6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPAP1Q9BWH6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPAP1Q9BWH6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPAP1Q9BWH6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPAP1Q9BWH6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPAP1Q9BWH6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPAP1Q9BWH6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPAP1Q9BWH6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPAP1Q9BWH6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPAP1Q9BWH6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPAP1Q9BWH6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPAP1Q9BWH6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPAP1Q9BWH6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPAP1Q9BWH6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP1Q9BWH6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP1Q9BWH6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP1Q9BWH6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP1Q9BWH6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP1Q9BWH6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP1Q9BWH6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP1Q9BWH6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms