Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms