Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNPPD1Q9BV87 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
CNPPD1Q9BV87 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNPPD1Q9BV87 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNPPD1Q9BV87 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNPPD1Q9BV87 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNPPD1Q9BV87 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNPPD1Q9BV87 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNPPD1Q9BV87 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms