Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV29

CCDC32, Coiled-coil domain-containing protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC32Q9BV29 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC32Q9BV29 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC32Q9BV29 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC32Q9BV29 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC32Q9BV29 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC32Q9BV29 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC32Q9BV29 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC32Q9BV29 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC32Q9BV29 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC32Q9BV29 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC32Q9BV29 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC32Q9BV29 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC32Q9BV29 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC32Q9BV29 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC32Q9BV29 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC32Q9BV29 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms