Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIOK1Q9BRS2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RIOK1Q9BRS2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms