Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MEIS3Q99687 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms