Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms