Protein–RNA interactions for Protein: Q96RR4

CAMKK2, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMKK2Q96RR4 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAMKK2Q96RR4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAMKK2Q96RR4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAMKK2Q96RR4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAMKK2Q96RR4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAMKK2Q96RR4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAMKK2Q96RR4 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAMKK2Q96RR4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAMKK2Q96RR4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAMKK2Q96RR4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAMKK2Q96RR4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms