Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms