Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP4Q96PP9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP4Q96PP9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms