Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLMNQ96JQ2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms