Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAMP1Q96JM3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms