Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms