Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY3

LIN37, Protein lin-37 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN37Q96GY3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms