Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT7

ASIC4, Acid-sensing ion channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC4Q96FT7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC4Q96FT7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms