Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms