Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLIP3Q96DZ5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms