Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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FAM3DQ96BQ1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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FAM3DQ96BQ1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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