Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms