Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms