Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms