Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms