Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms