Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CELF1Q92879 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms