Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZA2

RAPGEF4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF4Q8WZA2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF4Q8WZA2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF4Q8WZA2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF4Q8WZA2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF4Q8WZA2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF4Q8WZA2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF4Q8WZA2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF4Q8WZA2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF4Q8WZA2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF4Q8WZA2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF4Q8WZA2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF4Q8WZA2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF4Q8WZA2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF4Q8WZA2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF4Q8WZA2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF4Q8WZA2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF4Q8WZA2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF4Q8WZA2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF4Q8WZA2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF4Q8WZA2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF4Q8WZA2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF4Q8WZA2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF4Q8WZA2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF4Q8WZA2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF4Q8WZA2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF4Q8WZA2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF4Q8WZA2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF4Q8WZA2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF4Q8WZA2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF4Q8WZA2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF4Q8WZA2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF4Q8WZA2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF4Q8WZA2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF4Q8WZA2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF4Q8WZA2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF4Q8WZA2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF4Q8WZA2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF4Q8WZA2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF4Q8WZA2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF4Q8WZA2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF4Q8WZA2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF4Q8WZA2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RAPGEF4Q8WZA2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RAPGEF4Q8WZA2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEF4Q8WZA2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
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