Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms