Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms