Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C15orf40Q8WUR7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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