Protein–RNA interactions for Protein: Q8TER0

SNED1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNED1Q8TER0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNED1Q8TER0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNED1Q8TER0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNED1Q8TER0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNED1Q8TER0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNED1Q8TER0 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNED1Q8TER0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNED1Q8TER0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNED1Q8TER0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNED1Q8TER0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNED1Q8TER0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNED1Q8TER0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNED1Q8TER0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SNED1Q8TER0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNED1Q8TER0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNED1Q8TER0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNED1Q8TER0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNED1Q8TER0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNED1Q8TER0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SNED1Q8TER0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNED1Q8TER0 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SNED1Q8TER0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNED1Q8TER0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNED1Q8TER0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SNED1Q8TER0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms