Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
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FAT3Q8TDW7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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FAT3Q8TDW7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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FAT3Q8TDW7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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FAT3Q8TDW7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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FAT3Q8TDW7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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FAT3Q8TDW7 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
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FAT3Q8TDW7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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FAT3Q8TDW7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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FAT3Q8TDW7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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