Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms