Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms