Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms