Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC197Q8NCU1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC197Q8NCU1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC197Q8NCU1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC197Q8NCU1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC197Q8NCU1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC197Q8NCU1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC197Q8NCU1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC197Q8NCU1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC197Q8NCU1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC197Q8NCU1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC197Q8NCU1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC197Q8NCU1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC197Q8NCU1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC197Q8NCU1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC197Q8NCU1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC197Q8NCU1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC197Q8NCU1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC197Q8NCU1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC197Q8NCU1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC197Q8NCU1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC197Q8NCU1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC197Q8NCU1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC197Q8NCU1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC197Q8NCU1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC197Q8NCU1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC197Q8NCU1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC197Q8NCU1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC197Q8NCU1 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC197Q8NCU1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC197Q8NCU1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC197Q8NCU1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms