Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACBD4Q8NC06 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms