Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms